Situada en pleno corazón del barrio judío se levanta este edificio del que asegura Pedro Barrantes Madonado fue "Sinagoga". Con toda probabilidad la comunidad hebrea se asentó en este entorno, en las angostas y empinadas calles Pacheco, Balconcito, Soledad..., todas ellas de sabor popular, con un trazado irregular pero con una arquitectura que muestra gran uniformidad.{phocagallery view=category|categoryid=4|imageid=42|float=right}

Con la Reconquista, las zonas con menor densidad de población se verán favorecidas por la política de repoblación, esto entre otras cosas motivó que en 1489, esta comunidad se convirtiera en Aljama, por lo que debemos suponer que la población judía de la Villa de Alcántara llegó a ser bastante considerable.

Tras el edicto de expulsión de 1492, la mayoría de los judíos se refugian en Portugal, dejando atrás el edificio su etapa como sinagoga, pasando al culto cristiano.

Hasta hace poco tiempo perduró en el edificio una inscripción hebraica con la siguiente leyenda:

"Hizo esta magnificiencia (o preciosidad) Don Mosé Lerma / hijo de (¿) el honrado Rabí Ishaq Lerma (¿) - descanse en el Edén- en el año (expresado por la palabra) Hinnam (= 95, e. d. 1335)".

Probablemente, el primitivo edificio fue construido en el siglo XIV. En la Visita de 1618 se la nombra como Ermita de Nuestra Señora de la Misericordia.

El alzado actual es del siglo XVIII, de planta rectangular con una sola nave dividida en tres tramos, la cabecera está cubierta con una cúpula con linterna, en el muro del lado del evangelio se localiza un ábside cegado hasta hace unos años, con unas bellas pinturas murales que representan símbolos pasionistas.

Destaca también el espacio utilizado como sacristía, de planta rectangular y en la que pueden apreciarse sencillas ménsulas molduradas, una cúpula de extraordinaria factura, y decoración mural policromada en relieve de estilo rococó, con una inscripción que dice: "SE COLOCO ESTA IMAGEN A DEVOCIÓN DE BERNARDO ERNÁNDES, SANTIBANEZ Y SU MUJER CATALINA PEREZ SEBILLA AÑO DE 1783".